RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553162.5

MARS-232, Transcript of methionyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 2

Gene MARS, Length 575 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARS-232ENST00000553162 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.49■■■■■ 5.51
MARS-232ENST00000553162 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.31■■■■■ 4.68
MARS-232ENST00000553162 ABCC9O60706 1549 aa43.78■■■■■ 4.6
MARS-232ENST00000553162 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.97■■■■■ 4.31
MARS-232ENST00000553162 NACADO15069 1562 aa41.79■■■■■ 4.28
MARS-232ENST00000553162 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.46■■■■■ 4.23
MARS-232ENST00000553162 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.41■■■■■ 4.22
MARS-232ENST00000553162 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.13■■■■■ 4.17
MARS-232ENST00000553162 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.99■■■■■ 4.15
MARS-232ENST00000553162 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.9■■■■■ 4.14
MARS-232ENST00000553162 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.76■■■■■ 4.12
MARS-232ENST00000553162 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.64■■■■■ 4.1
MARS-232ENST00000553162 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.62■■■■■ 4.09
MARS-232ENST00000553162 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.34■■■■■ 4.05
MARS-232ENST00000553162 SCRIBQ14160 1630 aa40.28■■■■■ 4.04
MARS-232ENST00000553162 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.65■■■■□ 3.94
MARS-232ENST00000553162 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.61■■■■□ 3.93
MARS-232ENST00000553162 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.45■■■■□ 3.91
MARS-232ENST00000553162 NCAPD3P42695 1498 aa38.54■■■■□ 3.76
MARS-232ENST00000553162 SMARCA4P51532 1647 aa38.52■■■■□ 3.76
MARS-232ENST00000553162 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.46■■■■□ 3.75
MARS-232ENST00000553162 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.44■■■■□ 3.74
MARS-232ENST00000553162 SMARCA2P51531 1590 aa38.43■■■■□ 3.74
MARS-232ENST00000553162 HMGXB3Q12766 1538 aa38.33■■■■□ 3.73
MARS-232ENST00000553162 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.2■■■■□ 3.71
MARS-232ENST00000553162 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.12■■■■□ 3.69
MARS-232ENST00000553162 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.08■■■■□ 3.69
MARS-232ENST00000553162 ERCC6Q03468 1493 aa37.84■■■■□ 3.65
MARS-232ENST00000553162 CUX2O14529 1486 aa37.7■■■■□ 3.63
MARS-232ENST00000553162 NESP48681 1621 aa37.69■■■■□ 3.62
MARS-232ENST00000553162 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.63■■■■□ 3.62
MARS-232ENST00000553162 WIZO95785 1651 aa37.62■■■■□ 3.61
MARS-232ENST00000553162 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.46■■■■□ 3.59
MARS-232ENST00000553162 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.41■■■■□ 3.58
MARS-232ENST00000553162 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.38■■■■□ 3.57
MARS-232ENST00000553162 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.32■■■■□ 3.56
MARS-232ENST00000553162 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.27■■■■□ 3.56
MARS-232ENST00000553162 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.26■■■■□ 3.56
MARS-232ENST00000553162 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.12■■■■□ 3.53
MARS-232ENST00000553162 CFTRP13569 1480 aa37.04■■■■□ 3.52
MARS-232ENST00000553162 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.03■■■■□ 3.52
MARS-232ENST00000553162 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.97■■■■□ 3.51
MARS-232ENST00000553162 WDR62O43379 1518 aa36.94■■■■□ 3.5
MARS-232ENST00000553162 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.94■■■■□ 3.5
MARS-232ENST00000553162 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.78■■■■□ 3.48
MARS-232ENST00000553162 PRDM2Q13029 1718 aa36.71■■■■□ 3.47
MARS-232ENST00000553162 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
MARS-232ENST00000553162 ABCC8Q09428 1581 aa36.32■■■■□ 3.41
MARS-232ENST00000553162 TOPBP1Q92547 1522 aa36.29■■■■□ 3.4
MARS-232ENST00000553162 IFT140Q96RY7 1462 aa36.24■■■■□ 3.39
MARS-232ENST00000553162 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.22■■■■□ 3.39
MARS-232ENST00000553162 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.03■■■■□ 3.36
MARS-232ENST00000553162 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
MARS-232ENST00000553162 OSCARQ8IYS5 282 aa35.97■■■■□ 3.35
MARS-232ENST00000553162 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
MARS-232ENST00000553162 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
MARS-232ENST00000553162 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
MARS-232ENST00000553162 SOGA1O94964 1423 aa35.77■■■■□ 3.32
MARS-232ENST00000553162 CUX1P39880 1505 aa35.77■■■■□ 3.32
MARS-232ENST00000553162 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.76■■■■□ 3.32
MARS-232ENST00000553162 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.75■■■■□ 3.314e-7■■■■■ 37.8
MARS-232ENST00000553162 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.73■■■■□ 3.31
MARS-232ENST00000553162 WDR97A6NE52 1622 aa35.72■■■■□ 3.31
MARS-232ENST00000553162 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
MARS-232ENST00000553162 TRIM41Q8WV44 630 aa35.59■■■■□ 3.29
MARS-232ENST00000553162 CHD1O14646 1710 aa35.53■■■■□ 3.28
MARS-232ENST00000553162 GRIN2BQ13224 1484 aa35.46■■■■□ 3.27
MARS-232ENST00000553162 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.45■■■■□ 3.27
MARS-232ENST00000553162 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.45■■■■□ 3.27
MARS-232ENST00000553162 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.43■■■■□ 3.26
MARS-232ENST00000553162 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.43■■■■□ 3.26
MARS-232ENST00000553162 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.43■■■■□ 3.26
MARS-232ENST00000553162 FBLN2P98095 1184 aa35.43■■■■□ 3.26
MARS-232ENST00000553162 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.42■■■■□ 3.26
MARS-232ENST00000553162 ARHGEF11O15085 1522 aa35.4■■■■□ 3.26
MARS-232ENST00000553162 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.37■■■■□ 3.25
MARS-232ENST00000553162 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.36■■■■□ 3.25
MARS-232ENST00000553162 TOP2BQ02880 1626 aa35.35■■■■□ 3.25
MARS-232ENST00000553162 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.35■■■■□ 3.25
MARS-232ENST00000553162 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.32■■■■□ 3.24
MARS-232ENST00000553162 PBRM1Q86U86 1689 aa35.3■■■■□ 3.24
MARS-232ENST00000553162 SYNJ2O15056 1496 aa35.29■■■■□ 3.24
MARS-232ENST00000553162 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
MARS-232ENST00000553162 SYNJ1O43426 1573 aa35.27■■■■□ 3.24
MARS-232ENST00000553162 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.19■■■■□ 3.22
MARS-232ENST00000553162 ARAP1Q96P48 1450 aa35.06■■■■□ 3.2
MARS-232ENST00000553162 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.04■■■■□ 3.2
MARS-232ENST00000553162 ADAMTS12P58397 1594 aa35.03■■■■□ 3.2
MARS-232ENST00000553162 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.01■■■■□ 3.19
MARS-232ENST00000553162 GRIN2AQ12879 1464 aa34.99■■■■□ 3.19
MARS-232ENST00000553162 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.96■■■■□ 3.19
MARS-232ENST00000553162 NUP160Q12769 1436 aa34.87■■■■□ 3.17
MARS-232ENST00000553162 CEP170Q5SW79 1584 aa34.8■■■■□ 3.16
MARS-232ENST00000553162 KIF27Q86VH2 1401 aa34.7■■■■□ 3.15
MARS-232ENST00000553162 SHROOM2Q13796 1616 aa34.66■■■■□ 3.14
MARS-232ENST00000553162 CUL7Q14999 1698 aa34.58■■■■□ 3.13
MARS-232ENST00000553162 IGF1RP08069 1367 aa34.57■■■■□ 3.12
MARS-232ENST00000553162 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.57■■■■□ 3.12
MARS-232ENST00000553162 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.53■■■■□ 3.12
MARS-232ENST00000553162 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.52■■■■□ 3.12
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