Protein–RNA interactions for Protein: P59036

LINC00310, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00310, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00310P59036 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00310P59036 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00310P59036 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC00310P59036 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC00310P59036 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00310P59036 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00310P59036 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00310P59036 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00310P59036 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00310P59036 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00310P59036 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00310P59036 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LINC00310P59036 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LINC00310P59036 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00310P59036 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LINC00310P59036 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LINC00310P59036 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
LINC00310P59036 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LINC00310P59036 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LINC00310P59036 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00310P59036 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00310P59036 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00310P59036 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00310P59036 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LINC00310P59036 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LINC00310P59036 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LINC00310P59036 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LINC00310P59036 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00310P59036 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00310P59036 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00310P59036 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00310P59036 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00310P59036 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00310P59036 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00310P59036 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LINC00310P59036 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00310P59036 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00310P59036 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00310P59036 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00310P59036 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00310P59036 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00310P59036 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00310P59036 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00310P59036 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00310P59036 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00310P59036 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00310P59036 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00310P59036 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00310P59036 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00310P59036 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00310P59036 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00310P59036 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00310P59036 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00310P59036 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00310P59036 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00310P59036 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00310P59036 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00310P59036 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00310P59036 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00310P59036 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00310P59036 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00310P59036 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00310P59036 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00310P59036 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00310P59036 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00310P59036 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00310P59036 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00310P59036 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00310P59036 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00310P59036 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00310P59036 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00310P59036 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00310P59036 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00310P59036 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00310P59036 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00310P59036 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00310P59036 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00310P59036 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00310P59036 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00310P59036 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00310P59036 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00310P59036 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00310P59036 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00310P59036 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00310P59036 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00310P59036 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00310P59036 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00310P59036 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00310P59036 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00310P59036 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00310P59036 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00310P59036 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00310P59036 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00310P59036 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00310P59036 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00310P59036 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC00310P59036 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC00310P59036 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00310P59036 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00310P59036 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms