Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAPN7Q9Y6W3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPN7Q9Y6W3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN7Q9Y6W3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 258.5 ms