Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRAPPC8Q9Y2L5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.5 ms