Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEU3Q9UQ49 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NEU3Q9UQ49 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms