Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT9

IKZF3, Zinc finger protein Aiolos, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF3Q9UKT9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IKZF3Q9UKT9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IKZF3Q9UKT9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKZF3Q9UKT9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKZF3Q9UKT9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKZF3Q9UKT9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKZF3Q9UKT9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKZF3Q9UKT9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKZF3Q9UKT9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKZF3Q9UKT9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKZF3Q9UKT9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKZF3Q9UKT9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKZF3Q9UKT9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IKZF3Q9UKT9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKZF3Q9UKT9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKZF3Q9UKT9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IKZF3Q9UKT9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IKZF3Q9UKT9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IKZF3Q9UKT9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IKZF3Q9UKT9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IKZF3Q9UKT9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IKZF3Q9UKT9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IKZF3Q9UKT9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IKZF3Q9UKT9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IKZF3Q9UKT9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IKZF3Q9UKT9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IKZF3Q9UKT9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IKZF3Q9UKT9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IKZF3Q9UKT9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IKZF3Q9UKT9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IKZF3Q9UKT9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IKZF3Q9UKT9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IKZF3Q9UKT9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IKZF3Q9UKT9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms