Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDP1Q9P0J1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDP1Q9P0J1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms