Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
LRRC4BQ9NT99 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC4BQ9NT99 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms