Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM15Q9C019 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124 ms