Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM106CQ9BVX2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM106CQ9BVX2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM106CQ9BVX2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms