Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC34Q96HJ3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC34Q96HJ3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC34Q96HJ3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms