Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SIRT1Q96EB6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.6 ms