Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC38.47■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC38.47■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
TOPBP1Q92547 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC38.43■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC38.38■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC38.38■■■■□ 3.74
TOPBP1Q92547 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC38.34■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC38.34■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.5 ms