Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ70

SPDYA, Speedy protein A, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYAQ5MJ70 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPDYAQ5MJ70 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPDYAQ5MJ70 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPDYAQ5MJ70 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPDYAQ5MJ70 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPDYAQ5MJ70 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPDYAQ5MJ70 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPDYAQ5MJ70 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPDYAQ5MJ70 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPDYAQ5MJ70 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPDYAQ5MJ70 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPDYAQ5MJ70 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPDYAQ5MJ70 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms