Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC93Q567U6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC93Q567U6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.7 ms