Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPNMBQ14956 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPNMBQ14956 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
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