Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CUL4AQ13619 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CUL4AQ13619 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
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