Protein–RNA interactions for Protein: Q02447

SP3, Transcription factor Sp3, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP3Q02447 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SP3Q02447 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SP3Q02447 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SP3Q02447 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SP3Q02447 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SP3Q02447 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SP3Q02447 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SP3Q02447 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SP3Q02447 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
SP3Q02447 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SP3Q02447 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SP3Q02447 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
SP3Q02447 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SP3Q02447 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SP3Q02447 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SP3Q02447 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SP3Q02447 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SP3Q02447 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SP3Q02447 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SP3Q02447 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SP3Q02447 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SP3Q02447 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SP3Q02447 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SP3Q02447 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SP3Q02447 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SP3Q02447 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SP3Q02447 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SP3Q02447 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SP3Q02447 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SP3Q02447 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SP3Q02447 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SP3Q02447 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SP3Q02447 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SP3Q02447 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SP3Q02447 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SP3Q02447 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SP3Q02447 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SP3Q02447 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SP3Q02447 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SP3Q02447 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SP3Q02447 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SP3Q02447 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SP3Q02447 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SP3Q02447 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SP3Q02447 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SP3Q02447 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SP3Q02447 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SP3Q02447 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SP3Q02447 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SP3Q02447 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SP3Q02447 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SP3Q02447 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SP3Q02447 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SP3Q02447 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SP3Q02447 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SP3Q02447 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SP3Q02447 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SP3Q02447 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SP3Q02447 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SP3Q02447 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SP3Q02447 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SP3Q02447 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SP3Q02447 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SP3Q02447 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SP3Q02447 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SP3Q02447 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SP3Q02447 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SP3Q02447 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SP3Q02447 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SP3Q02447 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SP3Q02447 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SP3Q02447 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SP3Q02447 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SP3Q02447 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SP3Q02447 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SP3Q02447 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SP3Q02447 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SP3Q02447 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SP3Q02447 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SP3Q02447 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SP3Q02447 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SP3Q02447 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SP3Q02447 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SP3Q02447 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SP3Q02447 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SP3Q02447 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SP3Q02447 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SP3Q02447 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SP3Q02447 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SP3Q02447 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SP3Q02447 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SP3Q02447 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SP3Q02447 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SP3Q02447 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SP3Q02447 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SP3Q02447 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SP3Q02447 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SP3Q02447 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SP3Q02447 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SP3Q02447 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms