Protein–RNA interactions for Protein: P55268

LAMB2, Laminin subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB2P55268 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAMB2P55268 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAMB2P55268 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAMB2P55268 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LAMB2P55268 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAMB2P55268 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LAMB2P55268 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAMB2P55268 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAMB2P55268 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAMB2P55268 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAMB2P55268 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAMB2P55268 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAMB2P55268 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAMB2P55268 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMB2P55268 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMB2P55268 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMB2P55268 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMB2P55268 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMB2P55268 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMB2P55268 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMB2P55268 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMB2P55268 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMB2P55268 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
LAMB2P55268 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms