Protein–RNA interactions for Protein: P54219

SLC18A1, Chromaffin granule amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A1P54219 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC18A1P54219 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A1P54219 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms