Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24CP53992 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms