Protein–RNA interactions for Protein: P43358

MAGEA4, Melanoma-associated antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA4P43358 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAGEA4P43358 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAGEA4P43358 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAGEA4P43358 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAGEA4P43358 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAGEA4P43358 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAGEA4P43358 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAGEA4P43358 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAGEA4P43358 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
MAGEA4P43358 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAGEA4P43358 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAGEA4P43358 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEA4P43358 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEA4P43358 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms