Protein–RNA interactions for Protein: P40426

PBX3, Pre-B-cell leukemia transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX3P40426 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX3P40426 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX3P40426 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX3P40426 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX3P40426 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX3P40426 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX3P40426 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX3P40426 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX3P40426 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX3P40426 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX3P40426 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX3P40426 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX3P40426 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX3P40426 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX3P40426 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX3P40426 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX3P40426 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX3P40426 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX3P40426 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX3P40426 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX3P40426 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX3P40426 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX3P40426 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX3P40426 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX3P40426 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX3P40426 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PBX3P40426 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PBX3P40426 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PBX3P40426 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PBX3P40426 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PBX3P40426 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PBX3P40426 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PBX3P40426 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PBX3P40426 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PBX3P40426 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PBX3P40426 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PBX3P40426 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PBX3P40426 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PBX3P40426 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PBX3P40426 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PBX3P40426 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PBX3P40426 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PBX3P40426 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PBX3P40426 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PBX3P40426 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PBX3P40426 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PBX3P40426 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PBX3P40426 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PBX3P40426 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PBX3P40426 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PBX3P40426 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PBX3P40426 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PBX3P40426 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PBX3P40426 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PBX3P40426 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PBX3P40426 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PBX3P40426 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PBX3P40426 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PBX3P40426 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PBX3P40426 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PBX3P40426 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBX3P40426 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBX3P40426 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBX3P40426 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBX3P40426 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBX3P40426 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBX3P40426 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PBX3P40426 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBX3P40426 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBX3P40426 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBX3P40426 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX3P40426 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX3P40426 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX3P40426 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX3P40426 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX3P40426 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX3P40426 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX3P40426 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX3P40426 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX3P40426 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX3P40426 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX3P40426 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX3P40426 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX3P40426 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBX3P40426 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBX3P40426 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBX3P40426 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PBX3P40426 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBX3P40426 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PBX3P40426 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PBX3P40426 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBX3P40426 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBX3P40426 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBX3P40426 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX3P40426 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX3P40426 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX3P40426 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX3P40426 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX3P40426 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX3P40426 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms