Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DMDP11532 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DMDP11532 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DMDP11532 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DMDP11532 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DMDP11532 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DMDP11532 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DMDP11532 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DMDP11532 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DMDP11532 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DMDP11532 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DMDP11532 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DMDP11532 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DMDP11532 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DMDP11532 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DMDP11532 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DMDP11532 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DMDP11532 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DMDP11532 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DMDP11532 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DMDP11532 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DMDP11532 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DMDP11532 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DMDP11532 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DMDP11532 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DMDP11532 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DMDP11532 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DMDP11532 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DMDP11532 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DMDP11532 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DMDP11532 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DMDP11532 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DMDP11532 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DMDP11532 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DMDP11532 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DMDP11532 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DMDP11532 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DMDP11532 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DMDP11532 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DMDP11532 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DMDP11532 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DMDP11532 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DMDP11532 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DMDP11532 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DMDP11532 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DMDP11532 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DMDP11532 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DMDP11532 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DMDP11532 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DMDP11532 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DMDP11532 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DMDP11532 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DMDP11532 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DMDP11532 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DMDP11532 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DMDP11532 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DMDP11532 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DMDP11532 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DMDP11532 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DMDP11532 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DMDP11532 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DMDP11532 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DMDP11532 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DMDP11532 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DMDP11532 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DMDP11532 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DMDP11532 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DMDP11532 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DMDP11532 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DMDP11532 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DMDP11532 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DMDP11532 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DMDP11532 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DMDP11532 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DMDP11532 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DMDP11532 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DMDP11532 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DMDP11532 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DMDP11532 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DMDP11532 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DMDP11532 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DMDP11532 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DMDP11532 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DMDP11532 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DMDP11532 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DMDP11532 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DMDP11532 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DMDP11532 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DMDP11532 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DMDP11532 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DMDP11532 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DMDP11532 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DMDP11532 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DMDP11532 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DMDP11532 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DMDP11532 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DMDP11532 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DMDP11532 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DMDP11532 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DMDP11532 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
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