Protein–RNA interactions for Protein: P08134

RHOC, Rho-related GTP-binding protein RhoC, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOCP08134 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOCP08134 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOCP08134 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOCP08134 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOCP08134 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOCP08134 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOCP08134 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOCP08134 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOCP08134 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOCP08134 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOCP08134 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOCP08134 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOCP08134 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOCP08134 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOCP08134 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOCP08134 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOCP08134 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOCP08134 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOCP08134 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
RHOCP08134 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOCP08134 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOCP08134 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOCP08134 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOCP08134 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOCP08134 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOCP08134 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOCP08134 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOCP08134 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOCP08134 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOCP08134 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOCP08134 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOCP08134 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOCP08134 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOCP08134 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOCP08134 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOCP08134 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOCP08134 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RHOCP08134 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOCP08134 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOCP08134 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RHOCP08134 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RHOCP08134 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOCP08134 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RHOCP08134 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RHOCP08134 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RHOCP08134 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOCP08134 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RHOCP08134 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RHOCP08134 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOCP08134 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOCP08134 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOCP08134 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOCP08134 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOCP08134 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOCP08134 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOCP08134 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOCP08134 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOCP08134 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOCP08134 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOCP08134 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOCP08134 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOCP08134 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOCP08134 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOCP08134 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOCP08134 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOCP08134 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOCP08134 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOCP08134 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOCP08134 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOCP08134 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOCP08134 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOCP08134 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOCP08134 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOCP08134 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOCP08134 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOCP08134 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOCP08134 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOCP08134 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOCP08134 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOCP08134 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOCP08134 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOCP08134 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOCP08134 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOCP08134 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOCP08134 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOCP08134 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOCP08134 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOCP08134 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOCP08134 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOCP08134 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOCP08134 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOCP08134 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOCP08134 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOCP08134 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOCP08134 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RHOCP08134 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOCP08134 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOCP08134 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOCP08134 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOCP08134 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms