Protein–RNA interactions for Protein: A8MUH7

PDZK1P1, Putative PDZ domain-containing protein PDZK1P1, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1P1A8MUH7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZK1P1A8MUH7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZK1P1A8MUH7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDZK1P1A8MUH7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDZK1P1A8MUH7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDZK1P1A8MUH7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDZK1P1A8MUH7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZK1P1A8MUH7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZK1P1A8MUH7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZK1P1A8MUH7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms