Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPC6Q9Y210 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms