Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH36

SRRD, SRR1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRDQ9UH36 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SRRDQ9UH36 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRRDQ9UH36 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRRDQ9UH36 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRRDQ9UH36 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRRDQ9UH36 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRRDQ9UH36 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRRDQ9UH36 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms