Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
KDM5BQ9UGL1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
KDM5BQ9UGL1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
KDM5BQ9UGL1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
KDM5BQ9UGL1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
KDM5BQ9UGL1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
KDM5BQ9UGL1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
KDM5BQ9UGL1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
KDM5BQ9UGL1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
KDM5BQ9UGL1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
KDM5BQ9UGL1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
KDM5BQ9UGL1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
KDM5BQ9UGL1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
KDM5BQ9UGL1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
KDM5BQ9UGL1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
KDM5BQ9UGL1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
KDM5BQ9UGL1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
KDM5BQ9UGL1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
KDM5BQ9UGL1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
KDM5BQ9UGL1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
KDM5BQ9UGL1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
KDM5BQ9UGL1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
KDM5BQ9UGL1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
KDM5BQ9UGL1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
KDM5BQ9UGL1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
KDM5BQ9UGL1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
KDM5BQ9UGL1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
KDM5BQ9UGL1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
KDM5BQ9UGL1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
KDM5BQ9UGL1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
KDM5BQ9UGL1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
KDM5BQ9UGL1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
KDM5BQ9UGL1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
KDM5BQ9UGL1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms