Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHCHD3Q9NX63 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHCHD3Q9NX63 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CHCHD3Q9NX63 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CHCHD3Q9NX63 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHCHD3Q9NX63 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHCHD3Q9NX63 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHCHD3Q9NX63 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHCHD3Q9NX63 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CHCHD3Q9NX63 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHCHD3Q9NX63 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHCHD3Q9NX63 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms