Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV29

TMEM100, Transmembrane protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM100Q9NV29 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM100Q9NV29 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM100Q9NV29 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM100Q9NV29 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM100Q9NV29 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM100Q9NV29 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM100Q9NV29 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM100Q9NV29 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM100Q9NV29 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM100Q9NV29 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM100Q9NV29 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM100Q9NV29 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM100Q9NV29 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM100Q9NV29 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM100Q9NV29 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM100Q9NV29 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM100Q9NV29 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM100Q9NV29 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM100Q9NV29 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM100Q9NV29 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM100Q9NV29 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM100Q9NV29 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM100Q9NV29 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM100Q9NV29 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM100Q9NV29 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM100Q9NV29 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM100Q9NV29 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM100Q9NV29 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM100Q9NV29 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM100Q9NV29 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM100Q9NV29 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM100Q9NV29 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM100Q9NV29 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM100Q9NV29 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM100Q9NV29 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM100Q9NV29 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM100Q9NV29 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms