Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPTQ96BT3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPTQ96BT3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPTQ96BT3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPTQ96BT3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPTQ96BT3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPTQ96BT3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPTQ96BT3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPTQ96BT3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPTQ96BT3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPTQ96BT3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPTQ96BT3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPTQ96BT3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPTQ96BT3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPTQ96BT3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPTQ96BT3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPTQ96BT3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPTQ96BT3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPTQ96BT3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPTQ96BT3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPTQ96BT3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPTQ96BT3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPTQ96BT3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPTQ96BT3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPTQ96BT3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPTQ96BT3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPTQ96BT3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPTQ96BT3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPTQ96BT3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPTQ96BT3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPTQ96BT3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPTQ96BT3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPTQ96BT3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPTQ96BT3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPTQ96BT3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms