Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC47Q96A33 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC47Q96A33 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC47Q96A33 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
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