Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
LINC00116Q8NCU8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LINC00116Q8NCU8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms