Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC00301Q8NCQ3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LINC00301Q8NCQ3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LINC00301Q8NCQ3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 807.7 ms