Protein–RNA interactions for Protein: Q8N137

CNTROB, Centrobin, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROBQ8N137 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CNTROBQ8N137 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNTROBQ8N137 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNTROBQ8N137 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNTROBQ8N137 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNTROBQ8N137 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNTROBQ8N137 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CNTROBQ8N137 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNTROBQ8N137 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTROBQ8N137 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTROBQ8N137 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTROBQ8N137 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTROBQ8N137 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTROBQ8N137 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTROBQ8N137 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTROBQ8N137 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTROBQ8N137 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTROBQ8N137 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTROBQ8N137 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTROBQ8N137 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTROBQ8N137 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTROBQ8N137 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTROBQ8N137 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTROBQ8N137 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTROBQ8N137 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTROBQ8N137 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTROBQ8N137 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTROBQ8N137 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTROBQ8N137 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTROBQ8N137 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTROBQ8N137 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTROBQ8N137 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNTROBQ8N137 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNTROBQ8N137 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNTROBQ8N137 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNTROBQ8N137 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CNTROBQ8N137 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNTROBQ8N137 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNTROBQ8N137 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNTROBQ8N137 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNTROBQ8N137 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CNTROBQ8N137 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNTROBQ8N137 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTROBQ8N137 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms