Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXH7

NELFCD, Negative elongation factor C/D, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCDQ8IXH7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NELFCDQ8IXH7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms