Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR53Q7Z5U6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
WDR53Q7Z5U6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms