Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED27Q6P2C8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms