Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MICAQ29983 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MICAQ29983 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MICAQ29983 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MICAQ29983 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MICAQ29983 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MICAQ29983 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MICAQ29983 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MICAQ29983 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MICAQ29983 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MICAQ29983 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MICAQ29983 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MICAQ29983 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MICAQ29983 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MICAQ29983 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MICAQ29983 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MICAQ29983 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MICAQ29983 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MICAQ29983 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MICAQ29983 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MICAQ29983 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MICAQ29983 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MICAQ29983 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MICAQ29983 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MICAQ29983 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MICAQ29983 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MICAQ29983 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
MICAQ29983 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MICAQ29983 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MICAQ29983 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
MICAQ29983 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MICAQ29983 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MICAQ29983 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MICAQ29983 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MICAQ29983 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MICAQ29983 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
MICAQ29983 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MICAQ29983 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MICAQ29983 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
MICAQ29983 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MICAQ29983 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
MICAQ29983 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MICAQ29983 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MICAQ29983 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MICAQ29983 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MICAQ29983 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MICAQ29983 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MICAQ29983 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MICAQ29983 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MICAQ29983 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MICAQ29983 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MICAQ29983 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MICAQ29983 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MICAQ29983 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MICAQ29983 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MICAQ29983 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MICAQ29983 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MICAQ29983 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MICAQ29983 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MICAQ29983 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MICAQ29983 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MICAQ29983 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MICAQ29983 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MICAQ29983 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MICAQ29983 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MICAQ29983 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MICAQ29983 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MICAQ29983 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MICAQ29983 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MICAQ29983 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
MICAQ29983 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MICAQ29983 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MICAQ29983 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MICAQ29983 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MICAQ29983 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MICAQ29983 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MICAQ29983 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
MICAQ29983 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MICAQ29983 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MICAQ29983 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MICAQ29983 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MICAQ29983 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MICAQ29983 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MICAQ29983 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MICAQ29983 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MICAQ29983 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MICAQ29983 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MICAQ29983 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MICAQ29983 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MICAQ29983 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MICAQ29983 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MICAQ29983 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MICAQ29983 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MICAQ29983 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MICAQ29983 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MICAQ29983 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MICAQ29983 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MICAQ29983 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MICAQ29983 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MICAQ29983 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 234.6 ms