Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL19A1Q14993 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
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