Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPTAN1Q13813 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SPTAN1Q13813 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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