Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL6Q02878 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms