Protein–RNA interactions for Protein: P55285

CDH6, Cadherin-6, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH6P55285 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH6P55285 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH6P55285 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH6P55285 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH6P55285 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH6P55285 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH6P55285 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH6P55285 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH6P55285 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH6P55285 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH6P55285 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH6P55285 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH6P55285 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH6P55285 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH6P55285 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH6P55285 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH6P55285 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH6P55285 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH6P55285 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH6P55285 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH6P55285 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH6P55285 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH6P55285 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH6P55285 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH6P55285 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH6P55285 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH6P55285 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH6P55285 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH6P55285 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH6P55285 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH6P55285 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH6P55285 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH6P55285 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH6P55285 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH6P55285 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH6P55285 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH6P55285 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH6P55285 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH6P55285 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH6P55285 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH6P55285 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH6P55285 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH6P55285 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDH6P55285 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDH6P55285 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH6P55285 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH6P55285 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH6P55285 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH6P55285 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH6P55285 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH6P55285 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH6P55285 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH6P55285 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH6P55285 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH6P55285 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH6P55285 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH6P55285 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH6P55285 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH6P55285 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH6P55285 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH6P55285 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH6P55285 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH6P55285 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH6P55285 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH6P55285 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH6P55285 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH6P55285 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH6P55285 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH6P55285 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH6P55285 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH6P55285 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH6P55285 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH6P55285 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH6P55285 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH6P55285 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH6P55285 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH6P55285 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH6P55285 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH6P55285 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH6P55285 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH6P55285 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH6P55285 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH6P55285 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH6P55285 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH6P55285 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH6P55285 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH6P55285 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH6P55285 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH6P55285 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH6P55285 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH6P55285 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH6P55285 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH6P55285 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH6P55285 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH6P55285 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH6P55285 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH6P55285 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH6P55285 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH6P55285 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH6P55285 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms