Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSMD8P48556 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD8P48556 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms