Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TAF1P21675 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TAF1P21675 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TAF1P21675 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TAF1P21675 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TAF1P21675 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TAF1P21675 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TAF1P21675 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TAF1P21675 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TAF1P21675 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TAF1P21675 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TAF1P21675 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TAF1P21675 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TAF1P21675 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TAF1P21675 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TAF1P21675 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TAF1P21675 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TAF1P21675 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TAF1P21675 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TAF1P21675 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TAF1P21675 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TAF1P21675 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TAF1P21675 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TAF1P21675 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TAF1P21675 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TAF1P21675 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TAF1P21675 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TAF1P21675 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TAF1P21675 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TAF1P21675 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TAF1P21675 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TAF1P21675 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TAF1P21675 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TAF1P21675 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TAF1P21675 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TAF1P21675 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
TAF1P21675 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TAF1P21675 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TAF1P21675 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TAF1P21675 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TAF1P21675 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TAF1P21675 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TAF1P21675 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TAF1P21675 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TAF1P21675 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TAF1P21675 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TAF1P21675 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TAF1P21675 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TAF1P21675 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TAF1P21675 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TAF1P21675 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TAF1P21675 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TAF1P21675 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TAF1P21675 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TAF1P21675 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TAF1P21675 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TAF1P21675 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TAF1P21675 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TAF1P21675 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TAF1P21675 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TAF1P21675 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TAF1P21675 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TAF1P21675 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TAF1P21675 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TAF1P21675 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TAF1P21675 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TAF1P21675 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TAF1P21675 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TAF1P21675 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TAF1P21675 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF1P21675 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF1P21675 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF1P21675 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF1P21675 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF1P21675 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF1P21675 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF1P21675 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF1P21675 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF1P21675 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF1P21675 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF1P21675 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF1P21675 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF1P21675 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF1P21675 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF1P21675 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF1P21675 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF1P21675 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF1P21675 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF1P21675 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF1P21675 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TAF1P21675 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TAF1P21675 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TAF1P21675 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TAF1P21675 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TAF1P21675 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TAF1P21675 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TAF1P21675 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TAF1P21675 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TAF1P21675 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TAF1P21675 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms