Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP3P08254 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP3P08254 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP3P08254 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP3P08254 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP3P08254 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP3P08254 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP3P08254 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP3P08254 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP3P08254 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP3P08254 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP3P08254 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP3P08254 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP3P08254 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP3P08254 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP3P08254 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP3P08254 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP3P08254 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP3P08254 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP3P08254 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP3P08254 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP3P08254 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP3P08254 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP3P08254 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP3P08254 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP3P08254 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP3P08254 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP3P08254 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP3P08254 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP3P08254 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP3P08254 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP3P08254 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP3P08254 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP3P08254 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP3P08254 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP3P08254 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP3P08254 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP3P08254 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP3P08254 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP3P08254 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP3P08254 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP3P08254 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP3P08254 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP3P08254 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP3P08254 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP3P08254 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP3P08254 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP3P08254 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP3P08254 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP3P08254 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP3P08254 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP3P08254 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP3P08254 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP3P08254 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP3P08254 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP3P08254 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP3P08254 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP3P08254 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MMP3P08254 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MMP3P08254 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP3P08254 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP3P08254 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP3P08254 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP3P08254 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP3P08254 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP3P08254 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP3P08254 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP3P08254 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP3P08254 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP3P08254 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP3P08254 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP3P08254 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP3P08254 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP3P08254 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP3P08254 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP3P08254 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP3P08254 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP3P08254 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP3P08254 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP3P08254 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP3P08254 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP3P08254 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP3P08254 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP3P08254 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP3P08254 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP3P08254 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP3P08254 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP3P08254 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP3P08254 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP3P08254 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP3P08254 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP3P08254 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP3P08254 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP3P08254 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP3P08254 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP3P08254 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP3P08254 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP3P08254 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP3P08254 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP3P08254 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms