Protein–RNA interactions for Protein: P05771

PRKCB, Protein kinase C beta type, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCBP05771 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCBP05771 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms