Protein–RNA interactions for Protein: O60938

KERA, Keratocan, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KERAO60938 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KERAO60938 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KERAO60938 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KERAO60938 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KERAO60938 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KERAO60938 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KERAO60938 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KERAO60938 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KERAO60938 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KERAO60938 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KERAO60938 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KERAO60938 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KERAO60938 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KERAO60938 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KERAO60938 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KERAO60938 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KERAO60938 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KERAO60938 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KERAO60938 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KERAO60938 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KERAO60938 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KERAO60938 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KERAO60938 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KERAO60938 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KERAO60938 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KERAO60938 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KERAO60938 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KERAO60938 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KERAO60938 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KERAO60938 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KERAO60938 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KERAO60938 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KERAO60938 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KERAO60938 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KERAO60938 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KERAO60938 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KERAO60938 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KERAO60938 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KERAO60938 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KERAO60938 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KERAO60938 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KERAO60938 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KERAO60938 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KERAO60938 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KERAO60938 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KERAO60938 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KERAO60938 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KERAO60938 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KERAO60938 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KERAO60938 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KERAO60938 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KERAO60938 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KERAO60938 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KERAO60938 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KERAO60938 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KERAO60938 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KERAO60938 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KERAO60938 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KERAO60938 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KERAO60938 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KERAO60938 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KERAO60938 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KERAO60938 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KERAO60938 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KERAO60938 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KERAO60938 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KERAO60938 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KERAO60938 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KERAO60938 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KERAO60938 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KERAO60938 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KERAO60938 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KERAO60938 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KERAO60938 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KERAO60938 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KERAO60938 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KERAO60938 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KERAO60938 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KERAO60938 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KERAO60938 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KERAO60938 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KERAO60938 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KERAO60938 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KERAO60938 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KERAO60938 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KERAO60938 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KERAO60938 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KERAO60938 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KERAO60938 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KERAO60938 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KERAO60938 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KERAO60938 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KERAO60938 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KERAO60938 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KERAO60938 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KERAO60938 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KERAO60938 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KERAO60938 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KERAO60938 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KERAO60938 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms