Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRNO43815 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRNO43815 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRNO43815 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRNO43815 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRNO43815 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRNO43815 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
STRNO43815 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRNO43815 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRNO43815 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRNO43815 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRNO43815 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRNO43815 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRNO43815 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
STRNO43815 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRNO43815 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRNO43815 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRNO43815 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRNO43815 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRNO43815 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRNO43815 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRNO43815 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRNO43815 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRNO43815 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRNO43815 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRNO43815 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRNO43815 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRNO43815 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRNO43815 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRNO43815 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRNO43815 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
STRNO43815 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRNO43815 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRNO43815 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRNO43815 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
STRNO43815 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRNO43815 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRNO43815 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRNO43815 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRNO43815 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
STRNO43815 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
STRNO43815 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRNO43815 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRNO43815 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRNO43815 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRNO43815 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRNO43815 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
STRNO43815 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRNO43815 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
STRNO43815 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRNO43815 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRNO43815 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRNO43815 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRNO43815 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRNO43815 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRNO43815 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRNO43815 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRNO43815 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRNO43815 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRNO43815 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRNO43815 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRNO43815 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRNO43815 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRNO43815 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRNO43815 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
STRNO43815 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRNO43815 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRNO43815 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRNO43815 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRNO43815 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRNO43815 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRNO43815 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRNO43815 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRNO43815 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRNO43815 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRNO43815 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRNO43815 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRNO43815 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRNO43815 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
STRNO43815 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRNO43815 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRNO43815 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRNO43815 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRNO43815 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRNO43815 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRNO43815 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRNO43815 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRNO43815 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRNO43815 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRNO43815 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRNO43815 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
STRNO43815 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRNO43815 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
STRNO43815 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
STRNO43815 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRNO43815 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRNO43815 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
STRNO43815 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRNO43815 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRNO43815 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms